La Colección Patrimonial es el acervo bibliográfico, hemerográfico y de material de archivo que por su antigüedad, temática y rareza, merece tratamiento y uso distintos a los que se aplican a los materiales que forman parte de la Colección General. Fue creada respondiendo a las necesidades de conservación y difusión del patrimonio de la Biblioteca.

Biblioteca del Club Unión: donada en 1992; contiene libros y revistas en todas las áreas del conocimiento.

Colección de videocintas de ¾ para televisión. Programas de la Secretaría de Educación de Antioquia en temas como museos, educación, historia, derechos humanos, comunidades indígenas, memoria cultural.

Colección Samper Ortega, Biblioteca Aldeana, Colección del Instituto Lingüístico de Verano, especializada en literatura, lingüística y vocablos indígenas colombianos.

Libros raros y curiosos: fechados desde mediados del siglo XVIII, de Colombia y el mundo. Situados en esta colección por su antigüedad o sus características únicas de edición, contenido o ilustraciones.